Savukārt, komentējot Romas pāvesta Franciska izteikumus par homoseksualitāti, Rubenis norādīja, ka pāvests nevēlas pārmainīt kristīgos pamatprincipus, bet viņš kā pastorāls cilvēks ir sapratis to, ka,
sastopot grūtdieņus, «tu viņam nelasīsi priekšā dogmatiskas grāmatas,
tajā brīdī svarīga ir līdzjūtība un izpratne. Ja paliec pie doktrīnām, tu paliec tālu no cilvēka.»
«Viņš velk šo ļoti svarīgo kristīgo līniju, Jēzus līniju - mēs ar mīlestību nākam pie cilvēka,» uzsvēra mācītājs.
Vienlaikus viņš atzina, ka Latvijas sabiedrībā par šo jautājumu paredzamas lielas un ilgas diskusijas, bet ir ļoti nozīmīgi, ka Vatikānā ir aktualizēts jautājums par viendzimuma pāru attiecībām un baznīcas attieksmi pret tām.
Mācītājs norādīja, ka garīgā izaugsme liek arvien vairāk mācīties redzēt saturu, nevis saredzēt tikai kādas lietas «ārišķīgo burtu», nesaprotot, kādēļ «vārds vispār ir teikts».