Viens no iemesliem, kāpēc organizācijas tika nolemts likvidēt, bija apsūdzības par "ārvalstu aģentu" likuma pārkāpumiem un konkrēti tas, ka organizāciju materiālos nav bijis atbilstoša marķējuma.
Tieslietu ministrija un prokurori apgalvoja, ka "Memoriāls" sistemātiski slēpis informāciju par "ārvalstu aģenta" funkciju pildīšanu.
ECT norādīja, ka organizāciju likvidācija var notikt vienīgi pēc tam, kad būs pieņemts spriedums lietā par Krievijas "ārvalstu aģentu" likumu. Sūdzību par šo likumu ECT 2013.gadā iesniedza "Starptautiskais Memoriāls", cilvēktiesību centrs "Memoriāls" un vairākas citas nevalstiskās organizācijas.